RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cnpy2Q9QXT0 182 aa22.68■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp8b5A3FIN4 1183 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp17lbE9Q9U0 468 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gzf1Q4VBD9 706 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf18Q810A1 556 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ano10Q8BH79 659 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nrbp1Q99J45 535 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Txnrd3Q99MD6 652 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iqca1Q9CUL5 857 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RabggtaQ9JHK4 567 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mdh1bQ5F204 500 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OplahQ8K010 1288 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnk13Q8R1P5 405 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ipo4Q8VI75 1082 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr64Q9D565 1086 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa22.67■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adam7O35227 789 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C87499Q3UX49 493 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tm4sf1Q64302 202 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp49Q6P9L4 685 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vps16Q920Q4 839 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr119Q7TRJ5 321 aa22.66■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam178bQ24JP3 464 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo19Q5SV80 963 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nell2Q61220 819 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ano6Q6P9J9 911 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tacc1Q6Y685 774 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myoz2Q9JJW5 264 aa22.65■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alppl2P24823 529 aa22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp5P56399 858 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Armc2Q3URY6 854 aa22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AllcQ9JHX6 414 aa22.64■■□□□ 1.22
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam186bD3Z420 943 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 UncxO08934 530 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DSCC1Q14AI0 399 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prom2Q3UUY6 835 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrd1Q8C0R9 853 aa22.64■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rad23bP54728 416 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nbr1P97432 988 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pex1Q5BL07 1284 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tas2r124Q7M718 309 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clec16aQ80U30 1036 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mboat7Q8CHK3 473 aa22.63■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r68L7N2B3 851 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MarcksP26645 309 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep85Q8BMK0 761 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pdcl3Q8BVF2 240 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nod2Q8K3Z0 1020 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo1hQ9D6A1 958 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptf1aQ9QX98 324 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grin2dQ03391 1323 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zscan18E9PUD6 809 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gucy1a2F8VQK3 730 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nfil3O08750 462 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eef2P58252 858 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EgfrQ01279 1210 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MyrflQ3UN70 904 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xrcc4Q924T3 326 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klrc1Q9Z202 244 aa22.62■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ecm29Q6PDI5 1840 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GnaqP21279 359 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Filip1Q9CS72 1211 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd2apQ9JLQ0 637 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubxn8Q9QZ49 277 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp26c1B2RXA7 518 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KhnynQ80U38 671 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gga3Q8BMI3 718 aa22.61■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp13Q5BKP2 858 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nsrp1Q5NCR9 542 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zbed3Q9D0L1 228 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp831A2ADM8 1628 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myh8P13542 1937 aa22.6■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A0A0U1RNP2 1173 aa22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acad12D3Z7X0 555 aa22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SsbP32067 415 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa1468Q148V7 1216 aa22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slu7Q8BHJ9 585 aa22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem60Q8K174 133 aa22.59■■□□□ 1.21
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700003F12RikA2AKE5 210 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms