RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDKL5	O76039	1030 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MMP1	P03956	469 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IVL	P07476	585 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAGEA9	P43362	315 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	USP5	P45974	858 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLCD1	P51178	756 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DPYD	Q12882	1025 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYH3	P11055	1940 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	COBL	O75128	1261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CUL4B	Q13620	913 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	BRD3	Q15059	726 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	STK36	Q9NRP7	1315 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC175	P0C221	793 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	STX17	P56962	302 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRDN	Q13061	729 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.01	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	WNT7A	O00755	349 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CSF1R	P07333	972 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	VSNL1	P62760	191 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MCM6	Q14566	821 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MFAP3L	O75121	409 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	GYPC	P04921	128 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	APP	P05067	770 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDE6A	P16499	860 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFNAR1	P17181	557 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP25	P42331	645 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERVK-24	P63145	666 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM29	Q14134	588 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PACS2	Q86VP3	889 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC35F6	Q8N357	371 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM87B	Q96K49	555 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	VPS18	Q9P253	973 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NID2	Q14112	1375 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FECH	P22830	423 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC25A	P30304	524 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms