RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CA12O43570 354 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SHMT1P34896 483 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 EVX2Q03828 476 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SNAPC2Q13487 334 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SKAP1Q86WV1 359 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 RAD50Q92878 1312 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 GDF11O95390 407 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 TM4SF4P48230 202 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXP2O15409 715 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CETPP11597 493 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 ZMYM6O95789 1325 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L5A8MUK1 530 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CCL15Q16663 113 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 VPS53Q5VIR6 699 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CXCL11O14625 94 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 GH2P01242 217 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CHMLP26374 656 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNL1Q8IU54 200 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CABP5Q9NP86 173 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM22K7EJ46 135 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH1A1P00352 501 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK8P49336 464 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 ALX1Q15699 326 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM75PA6NK02 468 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXN1O15353 648 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 JAG1P78504 1218 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 PPARAQ07869 468 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC17Q96LX7 622 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF186Q9NXI6 227 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPA1O75762 1119 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR18Q9BV38 432 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE4BQ07343 736 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 SPP2Q13103 211 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 FGAP02671 866 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPN18Q99952 460 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-208ENST00000558954 AKR1B1P15121 316 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR2Q13614 643 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 IL25Q9H293 177 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP14Q460N5 1801 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 BTBD19C9JJ37 291 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L10C9JJH3 530 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 SGSM2O43147 1006 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 RASA1P20936 1047 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT2Q15019 361 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 FEZ1Q99689 392 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 TSKSQ9UJT2 592 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 C19orf81C9J6K1 198 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 GUCY1A2P33402 732 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 HMGCS2P54868 508 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 BACE1P56817 501 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 MOGSQ13724 837 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CASC1Q6TDU7 716 aa22.43■■□□□ 1.18
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