RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	WDR18	Q9BV38	432 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	EHD4	Q9H223	541 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	BCR	P11274	1271 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	KIF22	Q14807	665 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	GPATCH3	Q96I76	525 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-222	ENST00000556687	SMIM22	K7EJ46	135 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GH2	P01242	217 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SHMT1	P34896	483 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PSMC4	P43686	418 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	BACE1	P56817	501 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GABPA	Q06546	454 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MTMR2	Q13614	643 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ARHGEF6	Q15052	776 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	TRIM47	Q96LD4	638 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GINM1	Q9NU53	330 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	HTT	P42858	3142 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L10	C9JJH3	530 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	OSBP2	Q969R2	916 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MGAM	O43451	1857 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	C19orf81	C9J6K1	198 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L12	C9JPN9	530 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L21	D6R901	530 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MX1	P20591	662 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	OSBP	P22059	807 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GUCY1A2	P33402	732 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GCC1	Q96CN9	775 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ERC2	O15083	957 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GNRH1	P01148	92 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	IGHD	P01880	384 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	AAMP	Q13685	434 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SEPT2	Q15019	361 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	C12orf60	Q5U649	245 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ACER1	Q8TDN7	264 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ARMC5	Q96C12	935 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CABP5	Q9NP86	173 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SRRD	Q9UH36	339 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PNMA3	Q9UL41	463 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687		M0R2C6	588 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PEX10	O60683	326 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CTR9	Q6PD62	1173 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	APPBP2	Q92624	585 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	GABRQ	Q9UN88	632 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MYH8	P13535	1937 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CENPF	P49454	3210 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.71	□□□□□ -0.05

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