RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBRS	Q9HAH7	460 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GNA15	P30679	374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MLANA	Q16655	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433		H3BS24	57 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GLI1	P08151	1106 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GRK4	P32298	578 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GDNF	P39905	211 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KIR3DL1	P43629	444 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MESP2	Q0VG99	397 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CBX7	O95931	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ETV3	P41162	512 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NKG7	Q16617	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RLBP1	P12271	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAC2	P15153	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PDE4B	Q07343	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSPAN15	O95858	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PGR	P06401	933 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEPT6	Q14141	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GFRA2	O00451	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDK8	P49336	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LIG3	P49916	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TNK2	Q07912	1038 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NFIB	O00712	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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