RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537003.1

CD27-AS1-207, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 943 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-207ENST00000537003 MSRAQ9UJ68 235 aa11.63□□□□□ -0.55
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CD27-AS1-207ENST00000537003 ZNF853P0CG23 659 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 ALADP13716 330 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.57□□□□□ -0.56
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CD27-AS1-207ENST00000537003 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 IDI2Q9BXS1 227 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
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CD27-AS1-207ENST00000537003 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 A0A1W2PQY0 241 aa11.56□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.56□□□□□ -0.56
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CD27-AS1-207ENST00000537003 MTMR2Q13614 643 aa11.56□□□□□ -0.56
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CD27-AS1-207ENST00000537003 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.56□□□□□ -0.56
CD27-AS1-207ENST00000537003 IER5LQ5T953 404 aa11.56□□□□□ -0.56
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