RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531897.5

PUF60-216, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-216ENST00000531897 CABP5Q9NP86 173 aa26.76■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 VPS53Q5VIR6 699 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 CCDC17Q96LX7 622 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.74■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 CA12O43570 354 aa26.73■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 GDF11O95390 407 aa26.73■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 GJA5P36382 358 aa26.73■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 CDK8P49336 464 aa26.73■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.73■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.73■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.72■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.72■■□□□ 1.87
PUF60-216ENST00000531897 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.72■■□□□ 1.87
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PUF60-216ENST00000531897 WBP1LQ9NX94 342 aa26.7■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.7■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 CCL15Q16663 113 aa26.69■■□□□ 1.86
PUF60-216ENST00000531897 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.69■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.68■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.68■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 ZNF213O14771 459 aa26.65■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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PUF60-216ENST00000531897 RNF186Q9NXI6 227 aa26.62■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.62■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 BACE1P56817 501 aa26.61■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 ICA1Q05084 483 aa26.61■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.61■■□□□ 1.85
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