RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.02□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ASB2Q96Q27 587 aa13.02□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.02□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ADORA1P30542 326 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 RGS2P41220 211 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ERVK-9P63128 1117 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ERVK-24P63145 666 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ADGRE1Q14246 886 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CCDC184Q52MB2 194 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 LPIN2Q92539 896 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 LPAR1Q92633 364 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 APBA2Q99767 749 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SALL1Q9NSC2 1324 aa13.01□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 AK9Q5TCS8 1911 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 USP17L5A8MUK1 530 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 DNM1LO00429 736 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SLC5A1P13866 664 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MAPK4P31152 587 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PBX2P40425 430 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 BACE1P56817 501 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MAP2K5Q13163 448 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SNX17Q15036 470 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PAGR1Q9BTK6 254 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ZNF576Q9H609 170 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 REV3LO60673 3130 aa13□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 GRXCR1A8MXD5 290 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 EYA2O00167 538 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 DNAJB2P25686 324 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CNGA1P29973 690 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 9.8
CCNC-211ENST00000521017 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CCDC27Q2M243 656 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 FERMT2Q96AC1 680 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 WDR18Q9BV38 432 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 DNAJC18Q9H819 358 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 LTBP2Q14767 1821 aa12.99□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ABCB7O75027 752 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 TLE2Q04725 743 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PRDM12Q9H4Q4 367 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 EPHX3Q9H6B9 360 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.98□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CYBAP13498 195 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ADCYAP1R1P41586 468 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 RASGRF1Q13972 1273 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MFSD14CQ5VZR4 134 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 DOCK1Q14185 1865 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 IL16Q14005 1332 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PTPREP23469 700 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 MECOMQ03112 1051 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ATP2B3Q16720 1220 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 CCDC102BQ68D86 513 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 C16orf59Q7L2K0 433 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 TIFAQ96CG3 184 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 USP44Q9H0E7 712 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 SIL1Q9H173 461 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 BTBD7Q9P203 1132 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 THEGQ9P2T0 379 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 ABCF2Q9UG63 623 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 DENND2AQ9ULE3 1009 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNC-211ENST00000521017 GDF11O95390 407 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 HOXC6P09630 235 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 BMP1P13497 986 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 ATP2B2Q01814 1243 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 TFF2Q03403 129 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 DOCK2Q92608 1830 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 MUC6Q6W4X9 2439 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 GRB14Q14449 540 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 LRRC41Q15345 812 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 PI16Q6UXB8 463 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 23.4
CCNC-211ENST00000521017 PBX4Q9BYU1 374 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNC-211ENST00000521017 MYO9BQ13459 2157 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms