RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510403.5

SPOCK3-214, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 563 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-214ENST00000510403 CABP5Q9NP86 173 aa30.13■■■□□ 2.41
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SPOCK3-214ENST00000510403 CDK8P49336 464 aa30.12■■■□□ 2.41
SPOCK3-214ENST00000510403 GTF2A2P52657 109 aa30.12■■■□□ 2.41
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SPOCK3-214ENST00000510403 FGAP02671 866 aa30.11■■■□□ 2.41
SPOCK3-214ENST00000510403 TM4SF4P48230 202 aa30.11■■■□□ 2.41
SPOCK3-214ENST00000510403 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.11■■■□□ 2.41
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SPOCK3-214ENST00000510403 ANAPC4Q9UJX5 808 aa30.07■■■□□ 2.4
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SPOCK3-214ENST00000510403 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.06■■■□□ 2.4
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SPOCK3-214ENST00000510403 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.04■■■□□ 2.4
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SPOCK3-214ENST00000510403 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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SPOCK3-214ENST00000510403 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 MYH8P13535 1937 aa29.96■■■□□ 2.39
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SPOCK3-214ENST00000510403 TRPA1O75762 1119 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.96■■■□□ 2.39
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