RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR2	O60603	784 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GNRH1	P01148	92 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CRK	P46108	304 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT2	P55345	433 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GYG1	P46976	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR20E	P86478	221 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR20C	P86479	221 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR20D	P86480	221 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR20B	P86481	221 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR20A	P86496	221 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXO4	P98177	505 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD10	P28358	340 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	BRCA2	P51587	3418 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNB3	P54284	484 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT7B	P56706	349 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP290	O15078	2479 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511		F6X3S4	739 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC4	P43686	418 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	MTFR1	Q15390	333 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM8	O00222	908 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF9	O60383	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK4	P32298	578 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CTH	P32929	405 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN2A	P68543	259 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIL2	Q13356	520 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMB1	P07942	1786 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PDHX	O00330	501 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	DLL1	O00548	723 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GJB1	P08034	283 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL5	P13501	91 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PPAT	Q06203	517 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIK5	Q16478	980 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MAST3	O60307	1309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT7A	O00755	349 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA8	P48165	433 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGRT	P55899	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXC1	Q12948	553 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	IL16	Q14005	1332 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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