RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ENC1O14682 589 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 CTSWP56202 376 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RING1Q06587 406 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 INPP5AQ14642 412 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 KCT2Q8NC54 265 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RIN3Q8TB24 985 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 KCNN1Q92952 543 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.05□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.05□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.04□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 CD320Q9NPF0 282 aa6.04□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.04□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.03□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.03□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.03□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.03□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 USTQ9Y2C2 406 aa6.03□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.03□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 LINC00310P59036 64 aa6.02□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 LRRC14Q15048 493 aa6.02□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 CEP44Q9C0F1 390 aa6.02□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 CDK8P49336 464 aa6.01□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.01□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.98□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 ZNF605Q86T29 641 aa5.98□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 HID1Q8IV36 788 aa5.98□□□□□ -1.45
SENP6-210ENST00000487548 C20orf173Q96LM9 149 aa5.98□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 ESR1P03372 595 aa5.97□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 MAPK1P28482 360 aa5.97□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.97□□□□□ -1.45
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SENP6-210ENST00000487548 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.96□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 HPXP02790 462 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 DSC3Q14574 896 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.95□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 KIR3DL1P43629 444 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 SEPT6Q14141 434 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 SGPP1Q9BX95 441 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 DUSP13Q9UII6 198 aa5.94□□□□□ -1.46
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