RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRIG2O94898 1065 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEFLP07196 543 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGD1P98174 961 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 BDH2Q9BUT1 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCB6Q9NP58 842 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PICK1Q9NRD5 415 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPR3P17342 541 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTF4P34130 210 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAAP100Q0VG06 881 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 SGPP1Q9BX95 441 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FITM1A5D6W6 292 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM13AO94988 1023 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 NR0B2Q15466 257 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ESR1P03372 595 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFRSF1AP19438 455 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDE6BP35913 854 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIR3DL1P43629 444 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX17Q15036 470 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPM1JQ5JR12 505 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SP110Q9HB58 689 aa7.13□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS20P59510 1910 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLITRK5O94991 958 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATG7O95352 703 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF827Q17R98 1081 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.12□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 HRKO00198 91 aa7.11□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.11□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 PANK1Q8TE04 598 aa7.11□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.11□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7ESM1 405 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 FZD6O60353 706 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRIN3BO60391 1043 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 CILPO75339 1184 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP7A1P22680 504 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARNTP27540 789 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 RING1Q06587 406 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 SULF2Q8IWU5 870 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGA2P52926 109 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 MENTQ9BUN1 341 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPHS2Q9NP85 383 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CBX7O95931 251 aa7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHRNEQ04844 493 aa7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CREG2Q8IUH2 290 aa7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYT8Q8NBV8 401 aa7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIPEPQ99797 713 aa7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR14I1A6ND48 311 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 N4BP3O15049 544 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 MATN3O15232 486 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 FSHBP01225 129 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 NME2P22392 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNK2Q07912 1038 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTP5Q14D33 572 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR26Q9H7D7 661 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLAIN2Q9P270 581 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSADQ9Y600 493 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAP2P40123 477 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms