RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 C12orf60Q5U649 245 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 TNS4Q8IZW8 715 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 FKTNO75072 461 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 MOGSQ13724 837 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CABP5Q9NP86 173 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 C19orf81C9J6K1 198 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 USP17L12C9JPN9 530 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 USP17L21D6R901 530 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 SHMT1P34896 483 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CCDC17Q96LX7 622 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 TRIM75PA6NK02 468 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 M0R2C6 588 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 TLR2O60603 784 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 SPP2Q13103 211 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CTR9Q6PD62 1173 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PTPRFP10586 1907 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 HIP1O00291 1037 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PDHXO00330 501 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 GDF11O95390 407 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 GH2P01242 217 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF6Q15052 776 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ERO1AQ96HE7 468 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 USP17L10C9JJH3 530 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 BACE1P56817 501 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 PNMA3Q9UL41 463 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.64■■□□□ 1.22
SYF2-203ENST00000474160 TDO2P48775 406 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 SP3Q02447 781 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 RILPL2Q969X0 211 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 APPP05067 770 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CYP2D6P10635 497 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 USP14P54578 494 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CDK8P49336 464 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 JAG1P78504 1218 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 NAPBQ9H115 298 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 NEFLP07196 543 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 SDSP20132 328 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 PDE4AP27815 886 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 HMGCS2P54868 508 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 C17orf99Q6UX52 265 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 C12orf42Q96LP6 360 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 DGKZQ13574 1117 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MTMR2Q13614 643 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 ALX1Q15699 326 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 TTC22Q5TAA0 569 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 ZMYM6O95789 1325 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MYH8P13535 1937 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 GNRH1P01148 92 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 OSBPP22059 807 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 KIF22Q14807 665 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 SH2D4AQ9H788 454 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 GUCY1A2P33402 732 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 EVX2Q03828 476 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 580.6 ms