RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	KRT40	Q6A162	431 aa		21.27	■■□□□ 1
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		21.27	■■□□□ 1
GCFC2-208	ENST00000472230	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
GCFC2-208	ENST00000472230	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	DEXI	O95424	95 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	BICD2	Q8TD16	824 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	USP28	Q96RU2	1077 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	MXD3	Q9BW11	206 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	NMT2	O60551	498 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPY3	P0CV98	308 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPY8	P0CW00	308 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	PLCD1	P51178	756 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	MYH6	P13533	1939 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	ECE2	O60344	883 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TEKT1	Q969V4	418 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SCNN1D	P51172	638 aa		21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	NBPF11	Q86T75	865 aa		21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	KAT14	Q9H8E8	782 aa		21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TROAP	Q12815	778 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	PICALM	Q13492	652 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPY26P	Q9H489	355 aa		21.23	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF28P	B7ZC32	967 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	DGKH	Q86XP1	1220 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TTLL6	Q8N841	843 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	PGBD1	Q96JS3	809 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	USP40	Q9NVE5	1235 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	C21orf2	O43822	256 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CDK8	P49336	464 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	AOC3	Q16853	763 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		21.22	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	XBP1	P17861	261 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	STK38	Q15208	465 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	USP17L3	A6NCW0	530 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	USP17L4	A6NCW7	530 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	LIG1	P18858	919 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	GUCY1A2	P33402	732 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		21.21	■□□□□ 0.99
GCFC2-208	ENST00000472230	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	RASA1	P20936	1047 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF5B	P33176	963 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	CRK	P46108	304 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ME1	P48163	572 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	PPIP5K2	O43314	1243 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC93	Q567U6	631 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	PANK2	Q9BZ23	570 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	YEATS4	O95619	227 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	MMP1	P03956	469 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKS1A	Q92625	1134 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	RBSN	Q9H1K0	784 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	DACT2	Q5SW24	774 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC125	Q86Z20	511 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	PNMA1	Q8ND90	353 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	CLIC4	Q9Y696	253 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	21.18	■□□□□ 0.98	9e-8	■■■■□ 21.5
GCFC2-208	ENST00000472230	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	KLHL34	Q8N239	644 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	DACT1	Q9NYF0	836 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	SCN9A	Q15858	1988 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ANO1	Q5XXA6	986 aa		21.17	■□□□□ 0.98

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