RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466321.5

TMEM39B-204, Transcript of transmembrane protein 39B, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM39B, Length 770 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39B-204ENST00000466321 GPATCH3Q96I76 525 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SMIM22K7EJ46 135 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 PSMC4P43686 418 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 KIF22Q14807 665 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 TRIM47Q96LD4 638 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 BCRP11274 1271 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SHMT1P34896 483 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 TTC6Q86TZ1 520 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 EHD4Q9H223 541 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 RGS19P49795 217 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 UBE3CQ15386 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 WDR18Q9BV38 432 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 PEX10O60683 326 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 BACE1P56817 501 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 ARHGEF6Q15052 776 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-204ENST00000466321 OSBPP22059 807 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 GABPAQ06546 454 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ACER1Q8TDN7 264 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 USP17L10C9JJH3 530 aa22.13■■□□□ 1.13
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TMEM39B-204ENST00000466321 MX1P20591 662 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 OSBP2Q969R2 916 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 FEZ1Q99689 392 aa22.13■■□□□ 1.13
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TMEM39B-204ENST00000466321 GUCY1A2P33402 732 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 PRKCZQ05513 592 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SEPT2Q15019 361 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ARMC5Q96C12 935 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SRRDQ9UH36 339 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 PNMA3Q9UL41 463 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 MYPNQ86TC9 1320 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 USP17L12C9JPN9 530 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 USP17L21D6R901 530 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 M0R2C6 588 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 FCGRTP55899 365 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 GINM1Q9NU53 330 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 GABRQQ9UN88 632 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ZNF333Q96JL9 665 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 CABP5Q9NP86 173 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 MGAMO43451 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 ERC2O15083 957 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 RAET1EQ8TD07 263 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 APPBP2Q92624 585 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 FSD1Q9BTV5 496 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 C19orf81C9J6K1 198 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 AKR1B1P15121 316 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM39B-204ENST00000466321 C12orf60Q5U649 245 aa22.08■■□□□ 1.13
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