RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PCNTO95613 3336 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.18■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PTPRAP18433 802 aa20.18■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CDK8P49336 464 aa20.18■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 GRM1Q13255 1194 aa20.18■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PDE4BQ07343 736 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PPARAQ07869 468 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 SREBF2Q12772 1141 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 OTUD5Q96G74 571 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CABP5Q9NP86 173 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 LAMA4Q16363 1823 aa20.17■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 USP17L5A8MUK1 530 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CXCL11O14625 94 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 AOC2O75106 756 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 GTF2A2P52657 109 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.16■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 GJA5P36382 358 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 TM4SF4P48230 202 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 NT5C2P49902 561 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 EVX2Q03828 476 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 SNAPC2Q13487 334 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 WDR18Q9BV38 432 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 IL25Q9H293 177 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PTPRFP10586 1907 aa20.15■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 IRF6O14896 467 aa20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZNF213O14771 459 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 GDF11O95390 407 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 GH2P01242 217 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 FGRP09769 529 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CETPP11597 493 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SMIM22K7EJ46 135 aa20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 MAP4K1Q92918 833 aa20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CA12O43570 354 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ORC4O43929 436 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 RASA1P20936 1047 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 JAG1P78504 1218 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZIC5Q96T25 663 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 C19orf81C9J6K1 198 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ALDH1A1P00352 501 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.1■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 USP17L10C9JJH3 530 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 AKR1B1P15121 316 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 BACE1P56817 501 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 PTH1RQ03431 593 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SPP2Q13103 211 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 CCL15Q16663 113 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 WBP1LQ9NX94 342 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 TRIM75PA6NK02 468 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 GUCY1A2P33402 732 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 HAND2P61296 217 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SEPT2Q15019 361 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 IFNL1Q8IU54 200 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms