RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463553.1

TDRKH-208, Transcript of tudor and KH domain containing, humanhuman

TSL 3

Gene TDRKH, Length 371 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKH-208ENST00000463553 PALD1Q9ULE6 856 aa20.59■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.59■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 PFASO15067 1338 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 FLT1P17948 1338 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 GNAI2P04899 355 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 TRIM27P14373 513 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 CCL14Q16627 93 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 PORCNQ9H237 461 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.58■□□□□ 0.89
TDRKH-208ENST00000463553 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.58■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 FOCADQ5VW36 1801 aa20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ASNSP08243 561 aa20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 BMP8BP34820 402 aa20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.57■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 BCAR3O75815 825 aa20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.56■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 USP17L10C9JJH3 530 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 BAG3O95817 575 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 TNNI3KQ59H18 835 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.55■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ZAP70P43403 619 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 PPP4CP60510 307 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ERVK-9P63128 1117 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ERVK-24P63145 666 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 DEFB123Q8N688 67 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 USP6NLQ92738 828 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.54■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 C19orf81C9J6K1 198 aa20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 GPR142Q7Z601 462 aa20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 GH2P01242 217 aa20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 PDE3AQ14432 1141 aa20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 LHX8Q68G74 356 aa20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.52■□□□□ 0.88
TDRKH-208ENST00000463553 COL6A1P12109 1028 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 PLCG2P16885 1265 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MAPK4P31152 587 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MORN1Q5T089 497 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 TDHQ8IZJ6 230 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MYH1P12882 1939 aa20.51■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 CNMDO75829 334 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 CYP7A1P22680 504 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 POLA2Q14181 598 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 RGS2P41220 211 aa20.49■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 GPR108Q9NPR9 543 aa20.49■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 HLA-DOAP06340 250 aa20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 ACER1Q8TDN7 264 aa20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 APBA2Q99767 749 aa20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.48■□□□□ 0.87
TDRKH-208ENST00000463553 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms