RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9A7Q96T83 725 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC30A3Q99726 388 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPRAP18433 802 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PLCG1P19174 1290 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 STRN3Q13033 797 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR8Q96EF0 704 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM19Q9H013 955 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH19Q9H159 772 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.08□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM177BA6PVY3 158 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR39O43194 453 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 BRINP1O60477 761 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SELPP16109 830 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4BQ07343 736 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MLC1Q15049 377 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DHCR24Q15392 516 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 BBS9Q3SYG4 887 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NXNQ6DKJ4 435 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 HDXQ7Z353 690 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.07□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 BNIP3LO60238 219 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJA2O60884 412 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 THBS1P07996 1170 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SCARF1Q14162 830 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 IKBKEQ14164 716 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 KSR2Q6VAB6 950 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 HOOK2Q96ED9 719 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST12Q9NRB3 414 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM83GA6ND36 823 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 H7C1W4 665 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF10AO00220 468 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE2BO14633 110 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFR1P11362 822 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NEK4P51957 841 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R2AP63151 447 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 INPP5AQ14642 412 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 STAT4Q14765 748 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 SVIPQ8NHG7 77 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO41Q8TF61 875 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 MAF1Q9H063 256 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1P4-201ENST00000439415 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.05□□□□□ -1.44
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