RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAB2O43741 272 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KA4O75676 772 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC93Q567U6 631 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 AK7Q96M32 723 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ALX1Q15699 326 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT222Q8N1A0 295 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 NHSQ6T4R5 1651 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RASGRF1Q13972 1273 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 SETDB2Q96T68 719 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNDQ07001 517 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K12Q12852 859 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP1P03956 469 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNAR1P17181 557 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RFC4P35249 363 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 NARFQ9UHQ1 456 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 JAG2Q9Y219 1238 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 STK36Q9NRP7 1315 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP2B1P20020 1258 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TMX1Q9H3N1 280 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS13Q9NVM9 706 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 BCORQ6W2J9 1755 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CCP110O43303 1012 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 FGFR2P21802 821 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRK1P26718 216 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TDO2P48775 406 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF827Q17R98 1081 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF20AO95235 890 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR29P0C7W0 189 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 WASF1Q92558 559 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 GYG1P46976 350 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 NR5A1Q13285 461 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 POSTNQ15063 836 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN1Q16799 776 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.39■■□□□ 1.01
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SH3BP1-202ENST00000417536 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 PDILTQ8N807 584 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT23Q9C075 422 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.39■■□□□ 1.01
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SH3BP1-202ENST00000417536 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 WTAPQ15007 396 aa21.38■■□□□ 1.01
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SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCGO15287 622 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.38■■□□□ 1.01
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SH3BP1-202ENST00000417536 CHD4Q14839 1912 aa21.37■■□□□ 1.01
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SH3BP1-202ENST00000417536 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPREP23469 700 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM139Q8IV31 216 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 OXER1Q8TDS5 423 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCE1Q969G3 411 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH2A1L162 156 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO1BO43795 1136 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP6O43182 974 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN14P0C7P3 912 aa21.35■■□□□ 1.01
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