RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 SLC27A2O14975 620 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRC-206ENST00000413409 ATP2B3Q16720 1220 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRC-206ENST00000413409 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRC-206ENST00000413409 METTL24Q5JXM2 366 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRC-206ENST00000413409 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRC-206ENST00000413409 MAST3O60307 1309 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRC-206ENST00000413409 MGAMO43451 1857 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRC-206ENST00000413409 RPS6KB1P23443 525 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRC-206ENST00000413409 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRC-206ENST00000413409 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.21■□□□□ 0.83
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