RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.51■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.51■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 PALD1Q9ULE6 856 aa16.51■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 GDF11O95390 407 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 HERVK_113P62684 666 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CCL14Q16627 93 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 PORCNQ9H237 461 aa16.5■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 ASNSP08243 561 aa16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 DEFB123Q8N688 67 aa16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 USP6NLQ92738 828 aa16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 PPP4CP60510 307 aa16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.48■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 FLT1P17948 1338 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 FOCADQ5VW36 1801 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 C19orf81C9J6K1 198 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 USP17L10C9JJH3 530 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 BAG3O95817 575 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 GNAI2P04899 355 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM27P14373 513 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 ERVK-9P63128 1117 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 ERVK-24P63145 666 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 LHX8Q68G74 356 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 BCAR3O75815 825 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 COL6A1P12109 1028 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 MORN1Q5T089 497 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 GPR142Q7Z601 462 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 TDHQ8IZJ6 230 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.46■□□□□ 0.23
TTPAL-203ENST00000372906 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 PLCG2P16885 1265 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MAPK4P31152 587 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 ZAP70P43403 619 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 TNNI3KQ59H18 835 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 GPR153Q6NV75 609 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 CNMDO75829 334 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 GH2P01242 217 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 PDE3AQ14432 1141 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.44■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MYH1P12882 1939 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 RGS2P41220 211 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 POLA2Q14181 598 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 CYP7A1P22680 504 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 GPR108Q9NPR9 543 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.42■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 MAP2K5Q13163 448 aa16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 ACER1Q8TDN7 264 aa16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 APBA2Q99767 749 aa16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.41■□□□□ 0.22
TTPAL-203ENST00000372906 GINM1Q9NU53 330 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms