RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.49■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CYP2C19P33261 490 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 NR1I3Q14994 352 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SMIM22K7EJ46 135 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 BRINP3Q76B58 766 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 LRP5O75197 1615 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SLIT2O94813 1529 aa21.48■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 WASF1Q92558 559 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 PLCD1P51178 756 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 WTAPQ15007 396 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TAF3Q5VWG9 929 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 SPATA20Q8TB22 786 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 LPIN2Q92539 896 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CABP5Q9NP86 173 aa21.47■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 A0A1B0GTH6 734 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 WNT7AO00755 349 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 KRT23Q9C075 422 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.46■■□□□ 1.03
CITED2-201ENST00000367651 NUP98P52948 1817 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 STARD3NLO95772 234 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 STX17P56962 302 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 EPSTI1Q96J88 318 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 BCORQ6W2J9 1755 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 STRCQ7RTU9 1775 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB22O15209 634 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 PDE8AO60658 829 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 DEXIO95424 95 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 TDO2P48775 406 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 DACH1Q9UI36 760 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.45■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 MYH6P13533 1939 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 AFMP43652 599 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K12Q12852 859 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CCDC66A2RUB6 948 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 RBL2Q08999 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 FANCBQ8NB91 859 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 SLAIN2Q9P270 581 aa21.44■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 TPM1P09493 284 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ST5P78524 1137 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ITGB4P16144 1822 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 COBLO75128 1261 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.43■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 PRDM1O75626 825 aa21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 FAM193AP78312 1265 aa21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 CUL4BQ13620 913 aa21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.42■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 PBX1P40424 430 aa21.41■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 DPYDQ12882 1025 aa21.41■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.41■■□□□ 1.02
CITED2-201ENST00000367651 NEK11Q8NG66 645 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms