RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIAF1O95411 115 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCNFP41002 786 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 YARSP54577 528 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SQSTM1Q13501 440 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2orf27AQ580R0 203 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 VHLLQ6RSH7 139 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACAD11Q709F0 780 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATC1Q76KD6 591 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 EEPD1Q7L9B9 569 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE3DQ7Z6J8 389 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 HID1Q8IV36 788 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF214Q8ND24 703 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM13CQ8NE31 585 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF507Q8TCN5 953 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM87BQ96K49 555 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF208Q9H0X6 261 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRAGCQ9HB90 399 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 PICK1Q9NRD5 415 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM260Q9NX78 707 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ESYT3A0FGR9 886 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPDYE3A6NKU9 549 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNB5O14775 395 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 RGS13O14921 159 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 WFS1O76024 890 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBOX5O94941 541 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLSTN1O94985 981 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGEF15O94989 841 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELNP15502 786 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAG1P15918 1043 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAP2P40123 477 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHMP4BP1P59074 171 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC7A5Q01650 507 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTLL4Q14679 1199 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKG7Q16617 165 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC10A6Q3KNW5 377 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A19Q695T7 634 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 HOMER1Q86YM7 354 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM192Q8IY95 271 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 NEDD1Q8NHV4 660 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 APPBP2Q92624 585 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ISL2Q96A47 359 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLVAPQ9BX97 442 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 FANCLQ9NW38 375 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB10Q9UN67 800 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM229AH3BQW9 127 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUSD5O60279 629 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CST3P01034 146 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DRD2P14416 443 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMS1P54277 932 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SVOPQ8N4V2 548 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCT2Q8NC54 265 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPATCH3Q96I76 525 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A18Q96N87 628 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF2CQ99661 725 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPN3Q9H201 632 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACTL7BQ9Y614 415 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 F8W735 103 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIK3R2O00459 728 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADCY3O60266 1144 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASPAP45381 313 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 BBS9Q3SYG4 887 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNPTABQ3T906 1256 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms