RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343318.9

LRRD1-201, Transcript of leucine rich repeats and death domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRD1, Length 2,073 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1-201ENST00000343318 CAMK4Q16566 473 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RGS22Q8NE09 1264 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.52■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.51■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 FUT2Q10981 343 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SLF2Q8IX21 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CERS3Q8IU89 383 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TRIM29Q14134 588 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SHISA4Q96DD7 197 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 USP17L3A6NCW0 530 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 USP17L4A6NCW7 530 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 G3V3G9 751 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DEXIO95424 95 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PLCG2P16885 1265 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 ME1P48163 572 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SCNN1DP51172 638 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PPP2R5BQ15173 497 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DDAH1O94760 285 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 WASF1Q92558 559 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 EYA3Q99504 573 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 MMP1P03956 469 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RASA1P20936 1047 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PKN1Q16512 942 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 BTBD18B2RXH4 712 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CALM1P0DP23 149 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CALM2P0DP24 149 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CALM3P0DP25 149 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 MYH1P12882 1939 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 MYH6P13533 1939 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CDK8P49336 464 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 STK38Q15208 465 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 ANO1Q5XXA6 986 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 FBXO41Q8TF61 875 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CNKSR1Q969H4 720 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SCN9AQ15858 1988 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TSPY3P0CV98 308 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TSPY8P0CW00 308 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PICALMQ13492 652 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 PODNQ7Z5L7 613 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRD1-201ENST00000343318 FOCADQ5VW36 1801 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 YEATS4O95619 227 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 BAG6P46379 1132 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 TNMDQ9H2S6 317 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 SNED1Q8TER0 1413 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 SPTLC2O15270 562 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 MAP3K11Q16584 847 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 DGKHQ86XP1 1220 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 ECE2O60344 883 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 NR5A1Q13285 461 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 AOC3Q16853 763 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRD1-201ENST00000343318 OXER1Q8TDS5 423 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms