RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM151AQ8WW52 585 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.512e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR6Q9Y217 621 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNI2P48788 182 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 EVI5LQ96CN4 794 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FSD1Q9BTV5 496 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCP20941 246 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 GJB2P29033 226 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMT1Q9H993 441 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP1O95163 1332 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBP2Q969R2 916 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF3O75054 1194 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC192P0DO97 292 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE3CQ15386 1083 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2Q2LH0YL09 131 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FIBPO43427 364 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA5P28066 241 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MIGA2Q7L4E1 593 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAB2O43741 272 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD4O95243 580 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD1Q15327 319 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NECTIN1Q15223 517 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ENTPD3O75355 529 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 HUNKP57058 714 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SDR42E1Q8WUS8 393 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FLT1P17948 1338 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R2C6 588 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 USP2O75604 605 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC83Q8IWF9 413 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT85P78386 507 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FOCADQ5VW36 1801 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NF2P35240 595 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-201ENST00000246533 EVX2Q03828 476 aa30.65■■■□□ 2.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 APPBP2Q92624 585 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM196BA6NMK8 535 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GRM1Q13255 1194 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 USP5P45974 858 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF20Q5VTR2 975 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 AIDAQ96BJ3 306 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LARGE1O95461 756 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PTH1RQ03431 593 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1524Q8TCG1 905 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP4K1Q92918 833 aa30.61■■■□□ 2.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIF3AQ9Y496 699 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM22K7EJ46 135 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH1P12882 1939 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0D9SFI3 127 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GPAA1O43292 621 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K11Q16584 847 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SIPA1L1O43166 1804 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
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