RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 APBB1O00213 710 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CPA4Q9UI42 421 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CAP2P40123 477 aa28.72■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa28.72■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 FLT1P17948 1338 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K12Q12852 859 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MAGEB6Q8N7X4 407 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF22Q14807 665 aa28.7■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ARMC5Q96C12 935 aa28.7■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PALD1Q9ULE6 856 aa28.7■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 HTTP42858 3142 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM75PA6NK02 468 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2C8P10632 490 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 CTGFP29279 349 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 GADL1Q6ZQY3 521 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 CERS3Q8IU89 383 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 GNRH1P01148 92 aa28.67■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 BCRP11274 1271 aa28.67■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC18Q9H819 358 aa28.67■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 SPP2Q13103 211 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 DOCK1Q14185 1865 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L5A8MUK1 530 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 JAG1P78504 1218 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PSMC4P43686 418 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM47Q96LD4 638 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PRMT2P55345 433 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 BCL11AQ9H165 835 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 POTEFA5A3E0 1075 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 GOLIM4O00461 696 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP5JP18859 108 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 USP5P45974 858 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TREML2Q5T2D2 321 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF333Q96JL9 665 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR18Q9BV38 432 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HLA-DOAP06340 250 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PDE6AP16499 860 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SRRDQ9UH36 339 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SIPA1L1O43166 1804 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ASNSP08243 561 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF11Q86T75 865 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 GINM1Q9NU53 330 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 OSBPP22059 807 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HOXD10P28358 340 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HMGCS2P54868 508 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FOCADQ5VW36 1801 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPRFP10586 1907 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 HAUS7Q99871 368 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 EHD4Q9H223 541 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 DCTPP1Q9H773 170 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 GDF11O95390 407 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 BACE1P56817 501 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC6Q86TZ1 520 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms