RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 SPP2Q13103 211 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC102BQ68D86 513 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 ABCF2Q9UG63 623 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PLXNB2O15031 1838 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 ADORA1P30542 326 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 RASGRF1Q13972 1273 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 FAM196BA6NMK8 535 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 HMGCS2P54868 508 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 RHBDL3P58872 404 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 TRIB2Q92519 343 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PFASO15067 1338 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF521Q96K83 1311 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2C-208ENST00000617055 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 CYP2B6P20813 491 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 CAP2P40123 477 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MECOMQ03112 1051 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L5A8MUK1 530 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 TIMM10P62072 90 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 ANP32CO43423 234 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF384Q8TF68 577 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 COPRSQ9NQ92 184 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 COL6A1P12109 1028 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 GSTO1P78417 241 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 XAGE2Q96GT9 111 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GUL7 405 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 LDHCP07864 332 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MTMR2Q13614 643 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 WDR18Q9BV38 432 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-208ENST00000617055 VCANP13611 3396 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PEX10O60683 326 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PDE3AQ14432 1141 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 BACE1P56817 501 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 HERVK_113P62684 666 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 SIPA1L1O43166 1804 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 EYSQ5T1H1 3165 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 E9PSI1 815 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 MAPK4P31152 587 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 LHX8Q68G74 356 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 TEX11Q8IYF3 940 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 ASNSP08243 561 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 TFCP2Q12800 502 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PI16Q6UXB8 463 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 SPATA5Q8NB90 893 aa22.36■■□□□ 1.17
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