RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54-211ENST00000609454 DOCK2Q92608 1830 aa23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 CPA4Q9UI42 421 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 FLT1P17948 1338 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLIM4O00461 696 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 CAP2P40123 477 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 PALD1Q9ULE6 856 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L5A8MUK1 530 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 NBPF11Q86T75 865 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXD10P28358 340 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SPP2Q13103 211 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 C17orf99Q6UX52 265 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 GNRH1P01148 92 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP2C8P10632 490 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PNMA3Q9UL41 463 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PSMC4P43686 418 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 MOGSQ13724 837 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 ASNSP08243 561 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 TTC6Q86TZ1 520 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PDE6AP16499 860 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PRMT2P55345 433 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 GDF11O95390 407 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5JP18859 108 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 OSBPP22059 807 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 HMGCS2P54868 508 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 GPATCH3Q96I76 525 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 DOCK1Q14185 1865 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 FCGRTP55899 365 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 CAP1Q01518 475 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 RAET1EQ8TD07 263 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 GINM1Q9NU53 330 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 TREML2Q5T2D2 321 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ARMC5Q96C12 935 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIM47Q96LD4 638 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 HAUS7Q99871 368 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MTMR2Q13614 643 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR18Q9BV38 432 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC18Q9H819 358 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 CABP5Q9NP86 173 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 SRRDQ9UH36 339 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MYPNQ86TC9 1320 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 C19orf81C9J6K1 198 aa23.17■■□□□ 1.3
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