RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.95■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.95■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 GNRH1P01148 92 aa21.94■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 C17orf99Q6UX52 265 aa21.94■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 SLURP2P0DP57 97 aa21.93■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 FLT1P17948 1338 aa21.93■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 CAP2P40123 477 aa21.93■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.93■■□□□ 1.1
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CTIF-209ENST00000591387 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.93■■□□□ 1.1
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CTIF-209ENST00000591387 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.92■■□□□ 1.1
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CTIF-209ENST00000591387 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.92■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.92■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.91■■□□□ 1.1
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CTIF-209ENST00000591387 PRMT2P55345 433 aa21.91■■□□□ 1.1
CTIF-209ENST00000591387 CAP1Q01518 475 aa21.91■■□□□ 1.1
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CTIF-209ENST00000591387 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.89■■□□□ 1.09
CTIF-209ENST00000591387 PALD1Q9ULE6 856 aa21.89■■□□□ 1.09
CTIF-209ENST00000591387 USP17L5A8MUK1 530 aa21.88■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTIF-209ENST00000591387 BCRP11274 1271 aa21.87■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.87■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 CYP2C8P10632 490 aa21.86■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.85■■□□□ 1.09
CTIF-209ENST00000591387 TTC6Q86TZ1 520 aa21.85■■□□□ 1.09
CTIF-209ENST00000591387 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 DNAJC18Q9H819 358 aa21.85■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.85■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 ZNF333Q96JL9 665 aa21.83■■□□□ 1.09
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CTIF-209ENST00000591387 C19orf81C9J6K1 198 aa21.82■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 FCGRTP55899 365 aa21.82■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 TRIM47Q96LD4 638 aa21.82■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.086e-6■■■□□ 19.2
CTIF-209ENST00000591387 MYH7P12883 1935 aa21.81■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 CTGFP29279 349 aa21.81■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 HMGCS2P54868 508 aa21.81■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 BACE1P56817 501 aa21.81■■□□□ 1.08
CTIF-209ENST00000591387 TREML2Q5T2D2 321 aa21.81■■□□□ 1.08
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