RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	KLRG1	Q96E93	195 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ELP3	Q9H9T3	547 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2D6	P10635	497 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ECE1	P42892	770 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CAPNS2	Q96L46	248 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	INPP5B	P32019	993 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	VGLL4	Q14135	290 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L12	C9JPN9	530 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L21	D6R901	530 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	PLCD1	P51178	756 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	NAPB	Q9H115	298 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	CHML	P26374	656 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	VEGFB	P49765	207 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D12	O60347	775 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	EVX2	Q03828	476 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	VPS53	Q5VIR6	699 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	CTR9	Q6PD62	1173 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC102A	Q96A19	550 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	EHD4	Q9H223	541 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	LAMA4	Q16363	1823 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	SLC10A3	P09131	477 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC18	Q9H819	358 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	RAD50	Q92878	1312 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf60	Q5U649	245 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	PICK1	Q9NRD5	415 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GPS1-223	ENST00000584229	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	AOC2	O75106	756 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	GDF11	O95390	407 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CASC1	Q6TDU7	716 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	OPTN	Q96CV9	577 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	OTUD5	Q96G74	571 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM22	K7EJ46	135 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SBK1	Q52WX2	424 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CDC45	O75419	566 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	NOG	Q13253	232 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	IL25	Q9H293	177 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SWAP70	Q9UH65	585 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	FOXP2	O15409	715 aa		29.72	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SPRYD7	Q5W111	196 aa		29.72	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SHMT1	P34896	483 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	CAP2	P40123	477 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	ERO1B	Q86YB8	467 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	GABPA	Q06546	454 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	PPARA	Q07869	468 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRF	P10586	1907 aa		29.7	■■■□□ 2.34
GPS1-223	ENST00000584229	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GPS1-223	ENST00000584229	SGSM2	O43147	1006 aa		29.69	■■■□□ 2.34

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