RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 PPM1JQ5JR12 505 aa8.76□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 DRC1Q96MC2 740 aa8.76□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.76□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 IMPDH2P12268 514 aa8.75□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 NTF4P34130 210 aa8.75□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 CHRNA4P43681 627 aa8.75□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 KCT2Q8NC54 265 aa8.74□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 ARMC5Q96C12 935 aa8.74□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.74□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.74□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 GRIN3BO60391 1043 aa8.73□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 HTR3BO95264 441 aa8.73□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 ATP2B1P20020 1258 aa8.73□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.73□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 NEFMP07197 916 aa8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 PLCG1P19174 1290 aa8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 CAP2P40123 477 aa8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.72□□□□□ -1.01
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TSG101-211ENST00000580814 PPT2Q9UMR5 302 aa8.72□□□□□ -1.01
TSG101-211ENST00000580814 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 GATA4P43694 442 aa8.71□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.71□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.7□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.7□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.7□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SHDQ96IW2 340 aa8.7□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.7□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 RBL2Q08999 1139 aa8.69□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.68□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 MAP7Q14244 749 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SGO2Q562F6 1265 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
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TSG101-211ENST00000580814 UBXN4Q92575 508 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 TMEM87BQ96K49 555 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 FBRSQ9HAH7 460 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 GMIPQ9P107 970 aa8.68□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ITGB2P05107 769 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 NFICP08651 508 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.67□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.67□□□□□ -1.02
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