RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF862O60290 1169 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 CASP7P55210 303 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP12P59046 1061 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 RASA3Q14644 834 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 ILDR2Q71H61 639 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SNTG2Q9NY99 539 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 CTSBP07858 339 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 CDK8P49336 464 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 FXNQ16595 210 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 DDR2Q16832 855 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TM9SF2Q99805 663 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 GMIPQ9P107 970 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 SLFN14P0C7P3 912 aa8.57□□□□□ -1.04
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TMOD3-208ENST00000560725 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 DGKGP49619 791 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 INPP5AQ14642 412 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 GRIN2AQ12879 1464 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ADAM11O75078 769 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 WDR18Q9BV38 432 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 AOC2O75106 756 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 PLCG1P19174 1290 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 GUCY2CP25092 1073 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 PBRM1Q86U86 1689 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 NUP160Q12769 1436 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TOP2BQ02880 1626 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 RAC1P63000 192 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ERVK-24P63145 666 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ID3Q02535 119 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 RASGRF1Q13972 1273 aa8.54□□□□□ -1.04
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TMOD3-208ENST00000560725 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.54□□□□□ -1.04
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TMOD3-208ENST00000560725 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.54□□□□□ -1.04
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TMOD3-208ENST00000560725 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.53□□□□□ -1.04
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TMOD3-208ENST00000560725 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 FBXO11Q86XK2 927 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 RAD18Q9NS91 495 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-208ENST00000560725 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PQH9 124 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 PIK3R2O00459 728 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 ENPP3O14638 875 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 PDPK1O15530 556 aa8.52□□□□□ -1.05
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TMOD3-208ENST00000560725 HSD3B2P26439 372 aa8.52□□□□□ -1.05
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TMOD3-208ENST00000560725 RING1Q06587 406 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.52□□□□□ -1.05
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TMOD3-208ENST00000560725 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 PICK1Q9NRD5 415 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0A0MRY4 1105 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD62A6NC57 917 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-208ENST00000560725 DLL1O00548 723 aa8.51□□□□□ -1.05
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