RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP2B1P20020 1258 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSDMDP57764 484 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUTAO60888 179 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPARAQ07869 468 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNNM3Q8NE01 707 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 OXER1Q8TDS5 423 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNAT2P19087 354 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PARP10Q53GL7 1025 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM5Q71RC9 77 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCORQ6W2J9 1755 aa23.02■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 BMP6P22004 513 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAI14Q9P0K7 980 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNQ4P56696 695 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPM4P67936 248 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZMYND15Q9H091 742 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERICH2A1L162 156 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE4BQ07343 736 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHISA4Q96DD7 197 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 IKBKBO14920 756 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNQ2O43526 872 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCBQ8NB91 859 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCL9LQ86UU0 1499 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASF1Q92558 559 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM1O75626 825 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CBX1P83916 185 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERFEQ4G0M1 354 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNKSO95271 1327 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 NID2Q14112 1375 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM205CA6NFA0 338 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYL5Q02045 173 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 EVX2Q03828 476 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCLQ9NW38 375 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRR29P0C7W0 189 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBASH3AP57075 661 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP49Q70CQ1 688 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDILTQ8N807 584 aa22.98■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM232C9JQI7 657 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEXIO95424 95 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERPINC1P01008 464 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF827Q17R98 1081 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CABP5Q9NP86 173 aa22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEC23AQ15436 765 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFAP100Q494V2 611 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF384Q8TF68 577 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTL9Q8NET4 1388 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPREP23469 700 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 OLFM4Q6UX06 510 aa22.95■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.95■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRK1P26718 216 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms