RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	CAP2	P40123	477 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PDHX	O00330	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	GNRH1	P01148	92 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PTPRF	P10586	1907 aa		13.96	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	APBB1	O00213	710 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CAP1	Q01518	475 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	HAUS7	Q99871	368 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ASNS	P08243	561 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PDE6A	P16499	860 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	EHD4	Q9H223	541 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	GOLIM4	O00461	696 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	BCR	P11274	1271 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PRMT2	P55345	433 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CENPF	P49454	3210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SPP2	Q13103	211 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	KIF22	Q14807	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	MYH1	P12882	1939 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ADD2	P35612	726 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	USP5	P45974	858 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CYP2C8	P10632	490 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	JAG1	P78504	1218 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	AAMP	Q13685	434 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-223	ENST00000551137	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	BACE1	P56817	501 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GABPA	Q06546	454 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	HOXD10	P28358	340 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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