RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 BTBD18B2RXH4 712 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPREP23469 700 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 CYP2C19P33261 490 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 WDR24Q96S15 920 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 GREM2Q9H772 168 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 RAI14Q9P0K7 980 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 DCCP43146 1447 aa10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 NID2Q14112 1375 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 ADKP55263 362 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 CTSWP56202 376 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 MORC3Q14149 939 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT23Q9C075 422 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1-202ENST00000546471 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE8BO95263 885 aa10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 LRP6O75581 1613 aa10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC175P0C221 793 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR29P0C7W0 189 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 IL2RBP14784 551 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PHKA1P46020 1223 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PLCD1P51178 756 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RTN1Q16799 776 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RABGGTAQ92696 567 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA1Q92805 767 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNJ14Q9UNX9 436 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ERICH2A1L162 156 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 DEXIO95424 95 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF827Q17R98 1081 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 KIFC2Q96AC6 838 aa10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD4O95243 580 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TBC1D8O95759 1140 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GPTP24298 496 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GUCY1A2P33402 732 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GRIN1Q05586 938 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MAP3K12Q12852 859 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NR1I3Q14994 352 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 WTAPQ15007 396 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NLRP10Q86W26 655 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PANX2Q96RD6 677 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 INCENPQ9NQS7 918 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1B0GTH6 734 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 STARD3NLO95772 234 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SYNE4Q8N205 404 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 DESI2Q9BSY9 194 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NACAP1Q9BZK3 213 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TOMM22Q9NS69 142 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms