RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

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Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 USP17L21D6R901 530 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 FOXP2O15409 715 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 APLP1P51693 650 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 C12orf60Q5U649 245 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 CTR9Q6PD62 1173 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 IL25Q9H293 177 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 SWAP70Q9UH65 585 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 REC8O95072 547 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 KLRG1Q96E93 195 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRK-218ENST00000525459 WRNIP1Q96S55 665 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 GINM1Q9NU53 330 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRK-218ENST00000525459 MAP4K1Q92918 833 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRK-218ENST00000525459 HSPA6P17066 643 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 PTH1RQ03431 593 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC17Q96LX7 622 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTPRK-218ENST00000525459 FAM196BA6NMK8 535 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 SHMT1P34896 483 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 CAP2P40123 477 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 RNF20Q5VTR2 975 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-218ENST00000525459 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 FZD1Q9UP38 647 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 PICK1Q9NRD5 415 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 ORC4O43929 436 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 FGRP09769 529 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 INPP5BP32019 993 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 RGMBQ6NW40 437 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 MYH4Q9Y623 1939 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 EVX2Q03828 476 aa22.18■■□□□ 1.14
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