RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-216	ENST00000524481	BTD	P43251	543 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PLCD1	P51178	756 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PDE4B	Q07343	736 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SPTLC2	O15270	562 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ESPN	B1AK53	854 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	BECN2	A8MW95	431 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	BBOX1	O75936	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ADCY5	O95622	1261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TYRO3	Q06418	890 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ALX1	Q15699	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ADRA2B	P18089	450 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	NDUFA8	P51970	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	LDHC	P07864	332 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	ZNF165	P49910	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	LIFR	P42702	1097 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	NLRP5	P59047	1200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481	MYH3	P11055	1940 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-216	ENST00000524481		H0YIN7	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	C21orf2	O43822	256 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ZNF174	Q15697	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SEMA3E	O15041	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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