RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO27Q8NI29 283 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 RNF112Q9ULX5 631 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 NACADO15069 1562 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FANCGO15287 622 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 LEFTY1O75610 366 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 RLBP1P12271 317 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CDK5R2Q13319 367 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 NKG7Q16617 165 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 PAOXQ6QHF9 649 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FBXL6Q8N531 539 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 WDR64B1ANS9 1081 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 MAP7Q14244 749 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 GSC2O15499 205 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ADAMTS4O75173 837 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 CRKP46108 304 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 HDXQ7Z353 690 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 GGT7Q9UJ14 662 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 GRK4P32298 578 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 CD97P48960 835 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF394Q53GI3 561 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RELL1Q8IUW5 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PIDD1Q9HB75 910 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF76P36508 570 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 CAP2P40123 477 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJA2O60884 412 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 FAM87AP0C7U9 286 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PWP1Q13610 501 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RIN3Q8TB24 985 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC3Q9BY71 257 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 SLITRK5O94991 958 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 EOMESO95936 686 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 SPINK2P20155 84 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ITGAEP38570 1179 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 MSMPQ1L6U9 139 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ARTNQ5T4W7 220 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 UBP1Q9NZI7 540 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 PIM2Q9P1W9 311 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 FOSL1P15407 271 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 SSTR4P31391 388 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 REC114Q7Z4M0 266 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-209ENST00000522928 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms