RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 GFRA2O00451 464 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 MAP3K11Q16584 847 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 NETO1Q8TDF5 533 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-221ENST00000514231 LRIG2O94898 1065 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 CAP2P40123 477 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 CDK8P49336 464 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 IRAK1P51617 712 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 SEPT6Q14141 434 aa9.27□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 MISP3Q96FF7 219 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.27□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 OXCT1P55809 520 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 HID1Q8IV36 788 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 PHC3Q8NDX5 983 aa9.26□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 FOXQ1Q9C009 403 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 MCTP1Q6DN14 999 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.24□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-221ENST00000514231 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.24□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 U3KQE9 123 aa9.23□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 NKG7Q16617 165 aa9.22□□□□□ -0.93
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PDE4D-221ENST00000514231 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 SPRED2Q7Z698 418 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 HOMEZQ8IX15 550 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 GIPC2Q8TF65 315 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM74Q96NL1 305 aa9.21□□□□□ -0.94
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PDE4D-221ENST00000514231 BNIP3Q12983 259 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.19□□□□□ -0.94
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PDE4D-221ENST00000514231 SLC6A19Q695T7 634 aa9.19□□□□□ -0.94
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PDE4D-221ENST00000514231 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 RHOVQ96L33 236 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-221ENST00000514231 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.19□□□□□ -0.94
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