RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP2-225ENST00000513069 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-225ENST00000513069 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-225ENST00000513069 USP17L21D6R901 530 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-225ENST00000513069 GPAA1O43292 621 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-225ENST00000513069 ALDH1A1P00352 501 aa18.27■□□□□ 0.52
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SH3BP2-225ENST00000513069 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-225ENST00000513069 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-225ENST00000513069 GPR25O00155 361 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-225ENST00000513069 FOXP2O15409 715 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-225ENST00000513069 CRHR2Q13324 411 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-225ENST00000513069 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.25■□□□□ 0.51
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