RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497811.5

LINC00635-208, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00635, Length 856 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-208ENST00000497811 LEFTY1O75610 366 aa9.63□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 MSMPQ1L6U9 139 aa9.63□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.63□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.63□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 RHOVQ96L33 236 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM74Q96NL1 305 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.62□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 PF4P02776 101 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 LMNB2Q03252 620 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 RELL1Q8IUW5 271 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 KCT2Q8NC54 265 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 BCL11AQ9H165 835 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 FBRSQ9HAH7 460 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ADAMTS4O75173 837 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 NBPF11Q86T75 865 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 COPRSQ9NQ92 184 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 GRK4P32298 578 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC00635-208ENST00000497811 FAM221AA4D161 298 aa9.58□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.58□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PWP1Q13610 501 aa9.58□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 NKG7Q16617 165 aa9.58□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.58□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 CILPO75339 1184 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 LRIG2O94898 1065 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 F13A1P00488 732 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 HID1Q8IV36 788 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 U3KQE9 123 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 GARTP22102 1010 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 CAP2P40123 477 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PRNPP04156 253 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 BACH2Q9BYV9 841 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 FOXQ1Q9C009 403 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 GGT7Q9UJ14 662 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PGRP06401 933 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 SLITRK5O94991 958 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 BPNT1O95861 308 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 EOMESO95936 686 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 WNT11O96014 354 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC00635-208ENST00000497811 OXCT1P55809 520 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 PDE4BQ07343 736 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 RGS22Q8NE09 1264 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 FBXO27Q8NI29 283 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM87BQ96K49 555 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 MIPEPQ99797 713 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 RIN3Q8TB24 985 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 NETO1Q8TDF5 533 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00635-208ENST00000497811 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms