RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARNTP27540 789 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMC4Q7Z404 712 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SULF2Q8IWU5 870 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM161BQ96MY7 647 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ID3Q02535 119 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMD2Q13200 908 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT82Q9NSB4 513 aa8.12□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEFMP07197 916 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSHP09668 335 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASIP1Q5U651 963 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.11□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEACAM5P06731 702 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELA3AP09093 270 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL4Q14679 1199 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AOC3Q16853 763 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SV2BQ7L1I2 683 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.1□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNB2Q92953 911 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.08□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GIPC2Q8TF65 315 aa8.08□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.08□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIDD1Q9HB75 910 aa8.08□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QL4Q86Z23 238 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KSR1Q8IVT5 923 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMM50Q9Y512 469 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP31Q70CQ4 1352 aa8.07□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SORBS3O60504 671 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLFN14P0C7P3 912 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ISL2Q96A47 359 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBX8Q9HC52 389 aa8.06□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM84AQ96KN4 292 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.05□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM37O94972 964 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC14Q15048 493 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKN1Q16512 942 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRELD1Q96HD1 420 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFPP27918 469 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTF4P34130 210 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.03□□□□□ -1.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITIH2P19823 946 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FYB2Q5VWT5 728 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRS2Q9HD23 443 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.02□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT1P04264 644 aa8.01□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.01□□□□□ -1.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms