RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 USP17L12C9JPN9 530 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 USP17L21D6R901 530 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 TDO2P48775 406 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 CST9Q5W186 159 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 CTR9Q6PD62 1173 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 NAPBQ9H115 298 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 EHD4Q9H223 541 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 ECE1P42892 770 aa24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 C12orf60Q5U649 245 aa24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 FGAP02671 866 aa24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP3K11Q16584 847 aa24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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ARRDC1-211ENST00000495220 PLCD1P51178 756 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-211ENST00000495220 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
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ARRDC1-211ENST00000495220 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 GABPAQ06546 454 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP4K1Q92918 833 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CAPNS2Q96L46 248 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.455e-7■■■■□ 23.7
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CYP2D6P10635 497 aa24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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ARRDC1-211ENST00000495220 SWAP70Q9UH65 585 aa24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PTH1RQ03431 593 aa24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 SIPA1L1O43166 1804 aa24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CAPN15O75808 1086 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 REC8O95072 547 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP2K2P36507 400 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PPARAQ07869 468 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PRKG1Q13976 671 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.1■■□□□ 1.45
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ARRDC1-211ENST00000495220 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP3K9P80192 1104 aa24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 DNAJC18Q9H819 358 aa24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.09■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF213O14771 459 aa24.08■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 LBX1P52954 281 aa24.08■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.08■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.08■■□□□ 1.45
ARRDC1-211ENST00000495220 LAMB1P07942 1786 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM196BA6NMK8 535 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 EVX2Q03828 476 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 MOB2Q70IA6 237 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 WRNIP1Q96S55 665 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 GINM1Q9NU53 330 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 FZD1Q9UP38 647 aa24.07■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 SLURP2P0DP57 97 aa24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 CDK8P49336 464 aa24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 PDE4BQ07343 736 aa24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.06■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 SMIM22K7EJ46 135 aa24.05■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 FGRP09769 529 aa24.05■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 SHMT1P34896 483 aa24.05■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 HUNKP57058 714 aa24.05■■□□□ 1.44
ARRDC1-211ENST00000495220 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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