RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	EOMES	O95936	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	NUAK1	O60285	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GLDC	P23378	1020 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	NTF4	P34130	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GRM2	Q14416	872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	RELT	Q969Z4	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ARNT	P27540	789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	FCGRT	P55899	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC00310	P59036	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576		H3BS24	57 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNN1	Q92952	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	NDUFB5	O43674	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ICMT	O60725	284 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	RAC2	P15153	192 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	NME2	P22392	152 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576		H3BRB1	525 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	FANCG	O15287	622 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	FGD1	P98174	961 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR182	O15218	404 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	LRIG2	O94898	1065 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SLITRK5	O94991	958 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	BMP7	P18075	431 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ERVFC1	P60507	584 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	RING1	Q06587	406 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	SRF	P11831	508 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM107B-222	ENST00000488576	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms