RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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PTPRN-216ENST00000486480 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRN-216ENST00000486480 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRN-216ENST00000486480 USP17L21D6R901 530 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 IRF6O14896 467 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 FOXN1O15353 648 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRN-216ENST00000486480 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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PTPRN-216ENST00000486480 CTR9Q6PD62 1173 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRN-216ENST00000486480 TDO2P48775 406 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 SNAPC2Q13487 334 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRN-216ENST00000486480 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-216ENST00000486480 RNF186Q9NXI6 227 aa22.91■■□□□ 1.26
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