RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 PRKAB2O43741 272 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 SBK1Q52WX2 424 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 WRNIP1Q96S55 665 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.29■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.28■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 APPP05067 770 aa20.28■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 FZD1Q9UP38 647 aa20.28■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 MYH8P13535 1937 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 LAMB1P07942 1786 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 CAPNS2Q96L46 248 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-211ENST00000465282 RAD50Q92878 1312 aa20.27■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 USP17L12C9JPN9 530 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 USP17L21D6R901 530 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CHMLP26374 656 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 PLCD1P51178 756 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 NOGQ13253 232 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ALX1Q15699 326 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 IFFO2Q5TF58 517 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 C12orf60Q5U649 245 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 GINM1Q9NU53 330 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 DOCK1Q14185 1865 aa20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SLC10A3P09131 477 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 MAP2K2P36507 400 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 TDO2P48775 406 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 GABPAQ06546 454 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 VGLL4Q14135 290 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CTR9Q6PD62 1173 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SKAP1Q86WV1 359 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 NAPBQ9H115 298 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SWAP70Q9UH65 585 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 INPP5BP32019 993 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 VEGFBP49765 207 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ERO1BQ86YB8 467 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ZMYM6O95789 1325 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CAP2P40123 477 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 PICK1Q9NRD5 415 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SPRYD7Q5W111 196 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 CASC1Q6TDU7 716 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 DNAJC18Q9H819 358 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ELP3Q9H9T3 547 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.22■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 FAM196BA6NMK8 535 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 FOXP2O15409 715 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 ASNSP08243 561 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 PPATQ06203 517 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 VPS53Q5VIR6 699 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 WNK4Q96J92 1243 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.21■□□□□ 0.83
USP39-211ENST00000465282 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 SGSM2O43147 1006 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CYP2D6P10635 497 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 INHBEP58166 350 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PPIL2Q13356 520 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 OPTNQ96CV9 577 aa20.2■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CDC45O75419 566 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 FGAP02671 866 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 SLURP2P0DP57 97 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 SHMT1P34896 483 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 JMYQ8N9B5 988 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CCDC17Q96LX7 622 aa20.19■□□□□ 0.82
USP39-211ENST00000465282 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms