RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LAMB1	P07942	1786 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RAD50	Q92878	1312 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	APP	P05067	770 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	INPP5B	P32019	993 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VEGFB	P49765	207 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLCD1	P51178	756 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FOXP2	O15409	715 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TBC1D12	O60347	775 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GRM1	Q13255	1194 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VGLL4	Q14135	290 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SMIM22	K7EJ46	135 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TTC6	Q86TZ1	520 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP17L12	C9JPN9	530 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP17L21	D6R901	530 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IL25	Q9H293	177 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MYH8	P13535	1937 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATP6AP1-204	ENST00000439372	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SGSM2	O43147	1006 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC10A3	P09131	477 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EHD4	Q9H223	541 aa		27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.56	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TDO2	P48775	406 aa		27.56	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.56	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AOC2	O75106	756 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ECE1	P42892	770 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.55	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GJA5	P36382	358 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GABPA	Q06546	454 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NAPB	Q9H115	298 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.54	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.53	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.53	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.53	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ALX1	Q15699	326 aa		27.52	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.52	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.52	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		27.52	■■■□□ 2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SHMT1	P34896	483 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	JAG1	P78504	1218 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CAP2	P40123	477 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GDF11	O95390	407 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NOG	Q13253	232 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FGA	P02671	866 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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