RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439008.1

LINC00399-201, long intergenic non-protein coding RNA 399, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00399, Length 414 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00399-201ENST00000439008 TBC1D8O95759 1140 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 MX1P20591 662 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 ERO1BQ86YB8 467 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 IFNL1Q8IU54 200 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 STAP2Q9UGK3 403 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.08■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PTPRFP10586 1907 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CA12O43570 354 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 MBD4O95243 580 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PDE1AP54750 535 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 MOGSQ13724 837 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.07■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PTPRAP18433 802 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 NUCB1Q02818 461 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 SREBF2Q12772 1141 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PPIL2Q13356 520 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 UBE3CQ15386 1083 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 OSBP2Q969R2 916 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 GPATCH3Q96I76 525 aa16.06■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CYP2D6P10635 497 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 USP5P45974 858 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PLCD1P51178 756 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.05■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PPATQ06203 517 aa16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CCL15Q16663 113 aa16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 M0R2C6 588 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PDE4AP27815 886 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CAP2P40123 477 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 GTF2A2P52657 109 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 INHBEP58166 350 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CAP1Q01518 475 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CERS3Q8IU89 383 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 HTTP42858 3142 aa16.03■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 BTBD19C9JJ37 291 aa16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 ERC2O15083 957 aa16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 CRHR2Q13324 411 aa16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LINC00399-201ENST00000439008 GPR25O00155 361 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 GDF11O95390 407 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 GABPAQ06546 454 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 SNAPC2Q13487 334 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 DGKZQ13574 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 APPBP2Q92624 585 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.01■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 GSG1L2A8MUP6 293 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 CETPP11597 493 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 SHMT1P34896 483 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 TATDN1Q6P1N9 297 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 EHD4Q9H223 541 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 PICK1Q9NRD5 415 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 TRIM75PA6NK02 468 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 FOXP2O15409 715 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 HLA-DOAP06340 250 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 TNS4Q8IZW8 715 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 FSD1Q9BTV5 496 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.99■□□□□ 0.15
LINC00399-201ENST00000439008 USP17L12C9JPN9 530 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms