RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429051.1

RCC1-208, Transcript of regulator of chromosome condensation 1, human

TSL 3

Gene RCC1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCC1-208	ENST00000429051	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	PTPRA	P18433	802 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RCC1-208	ENST00000429051	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PDE6A	P16499	860 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SP3	Q02447	781 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	AAMP	Q13685	434 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	HAUS7	Q99871	368 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	MYH7	P12883	1935 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TLR2	O60603	784 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PDHX	O00330	501 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	CAP2	P40123	477 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	KIF22	Q14807	665 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PTPRF	P10586	1907 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ASNS	P08243	561 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SLC34A2	O95436	690 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ADD2	P35612	726 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	MOGS	Q13724	837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	EHD4	Q9H223	541 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	ERC2	O15083	957 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RCC1-208	ENST00000429051	GNRH1	P01148	92 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	SPP2	Q13103	211 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	MBD4	O95243	580 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	GDF11	O95390	407 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RCC1-208	ENST00000429051	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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