RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 GPTP24298 496 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TFCP2Q12800 502 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DENND2CQ68D51 928 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 USP19O94966 1318 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 AOX1Q06278 1338 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRAF5O00463 557 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ERCC3P19447 782 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PDE4DQ08499 809 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CASP8Q14790 479 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RPS6KA1Q15418 735 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZNF827Q17R98 1081 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CROCCP2Q86T23 111 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FCHSD1Q86WN1 690 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ENC1O14682 589 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 OPHN1O60890 802 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 KSR2Q6VAB6 950 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ABCB6Q9NP58 842 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 HHATQ5VTY9 493 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 NELFBQ8WX92 580 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 POLKQ9UBT6 870 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TSKSQ9UJT2 592 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SBNO1A3KN83 1393 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FERMT2Q96AC1 680 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ST7Q9NRC1 585 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STX2P32856 288 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRIM58Q8NG06 486 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 COG7P83436 770 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 BIRC2Q13490 618 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 GUCY2CP25092 1073 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RASSF2P50749 326 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA8P51970 172 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ASIC2Q16515 512 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CFAP157Q5JU67 520 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 KRT79Q5XKE5 535 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 KRT40Q6A162 431 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 GRIN2BQ13224 1484 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 INSRP06213 1382 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SPOPO43791 374 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STARD3NLO95772 234 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CALML3P27482 149 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 NAPAP54920 295 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 POLE2P56282 527 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CUL5Q93034 780 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRIM66O15016 1216 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 HSPA1LP34931 641 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 BLZF1Q9H2G9 400 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZPR1O75312 459 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 GUCY2DQ02846 1103 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 PTH1RQ03431 593 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 FOXO3O43524 673 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 COPS6Q7L5N1 327 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 TEX11Q8IYF3 940 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 ERMNQ8TAM6 284 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 PHKBQ93100 1093 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 FAM169AQ9Y6X4 670 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 VWA3BQ502W6 1294 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-202ENST00000402738 BICD1Q96G01 975 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms